A água é essencial para o desempenho do animal e pode interferir em vários processos de produção, tais como a saúde animal. Antimicrobianos são amplamente utilizados na produção animal e podem ser uma ameaça para a saúde humana e animal. Com isso, a pesquisa para detectar os genes de resistência a antibióticos (ARGs) em ambientes aquáticos é importante para identificar potenciais reservatórios microrganismos resistentes A metagenômica baseia-se na análise de moléculas de DNA genômico a partir de populações microbianas de amostras ambientais, e tem sido proposta por ser a técnica mais acurada para descrever as comunidades microbianas presentes em um habitat.
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