O presente trabalho determinou a ocorrência de anticorpos contra os vírus das encefalomielites virais equinas leste (EEL), oeste (EEO) e venezuelana (EEV) e Anemia infecciosa equina (AIE) em equídeos dos biomas amazônico, pantaneiro e cerrado do Estado de Mato Grosso, utilizando banco de soros do Laboratório de Sanidade Animal (LASA) do Instituto de Defesa Agropecuária de Mato Grosso referente ao ano de 2008. A detecção de anticorpos contra AIE foi realizada em 886 soros pela prova de Imunodifusão em gel de ágar (IDGA) enquanto que a detecção de anticorpos contra os vírus EEL, EEO e EEV foi realizada em 473 soros pela microtécnica de soroneutralização viral em culturas de células VERO. Para AIE, 46 (5,1%) equídeos foram positivos e nas encefalites virais 168 (35,5%) equídeos positivos foram detectados para EEL e 31 (6,5%) para EEV. As maiores frequências (P<0,05) de animais positivos foram observadas no Pantanal e na Amazônia para AIE e EEL respectivamente
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