O ICET tem em sua estrutura administrativa pedagógica os Cursos de Graduação em Licenciatura Plena em Matemática, Licenciatura em Química, Licenciatura em Matemática EAD, Bacharelado em Química e Bacharelado em Estatística; Programas de Pós-Graduação “stricto sensu”: Mestrado em Química (PPGQ). Mestrado em Profissional em Matemática (PROFMAT) e Doutorado em Educação em Ciências e Matemática (REAMEC). 

Todos os servidores efetivos ou não que desenvolvem atividades no ICET atuam de forma direta ou indireta no ensino, na pesquisa e na extensão, não estando dissociada uma da outra.

 A estrutura organizacional administrativa encontra-se constituída pelos órgãos colegiados: Congregação do ICET; Colegiados de Cursos de Graduação; Colegiados de Cursos de Pós-graduação e Colegiados de Departamentos.

Sua estrutura administrativa possui: Diretoria composta pelo Diretor e Vice-Diretor; Coordenações de Ensino de Graduação; Coordenações de Ensino de Pós-Graduação e Chefias de Departamentos. 

A Diretoria é o órgão executivo superior da administração, planejamento, organização, supervisão, controle, coordenação, acompanhamento e avaliação de todas as atividades do ICET.