O objetivo do Programa de Pós-graduação em Agricultura Tropical (PPGAT) é formar profissionais capacitados para atuar na investigação, manejo e ensino dos agroecossistemas tropicais.O PPGAT estabelece como ponto fundamental de sua atuação a compreensão dos sistemas agrícolas tropicais.Desta forma, apresenta os seguintes objetivos específicos:

a) Consolidar as áreas estratégicas de manejo e produção de espécies vegetais (cultivadas, nativas e medicinais) em regiões tropicais;

b) Consolidar os sistemas de produção tropicais e o manejo dos recursos naturais nos agroecossistemas tropicais;

c) Transformar o PPGAT em referência nacional e internacional na abordagem de sistemas de produção em ambientes tropicais; e

d) Consolidar os grupos de pesquisa da FAAZ (Antiga FAMEVZ).