O Instituto de Ciências Naturais, Humanas e Sociais (ICNHS) do Campus Universitário de Sinop (CUS), vinculado à Universidade Federal de Mato Grosso (UFMT), foi fundado no dia 12 de dezembro de 2008, por meio da Resolução CD nº 047, a qual criou o Campus Universitário de Sinop e três institutos: Instituto de Ciências Naturais, Humanas e Sociais (ICNHS), Instituto de Ciências da Saúde (ICS) e o Instituto de Ciências Agrárias e Ambientais (ICAA). 

Inicialmente, ele contava com os cursos de graduação em Licenciatura em Ciências Naturais e Matemática com habilitações em Química, Física e Matemática. Posteriormente, em 2023, os cursos de graduação em Química Bacharelado, Física - Licenciatura, Matemática - Licenciatura e Ciências Biológicas - Licenciatura foram criados e vinculados ao Instituto. 

O primeiro diretor do ICNHS foi o Professor Doutor Fabiano César Cardoso, que esteve à frente da gestão de 2008 a 2009. Em seguida, o Professor Doutor Ricardo Lopes de Andrade assumiu a direção, permanecendo no cargo de 2010 a 2017. Posteriormente, o Professor Doutor Leandro Dênis Battirola liderou o instituto de 2017 a 2020. A gestão seguinte ficou sob a responsabilidade da Professora Doutora Larissa Cavalheiro da Silva, que ocupou o cargo de 2021 a 2025. Atualmente, a direção do ICNHS está sob a liderança da Professora Doutora Rafaella Teles Arantes Felipe, que tomou posse em 2025. 

O ICNHS também conta com três programas de pós-graduações, os quais são: Mestrado em Ciências Ambientais, Mestrado em Ensino de Ciências da Natureza e Matemática e Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade.  

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