O Departamento de Química faz parte do Instituto de Química oferta os cursos de graduação de Bacharelado em Química com Atribuições Tecnológicas e Licenciatura Plena em Química, bem como o Programa de Pós-graduação em Química.

 Sua estrutura contempla, atualmente, conta com 05 (cinco) laboratórios didáticos (Laboratório de Bioquímica, Laboratório de Físico-Química/Analítica e Laboratório de Inorgânica/Orgânica) e 11 (onze)  laboratórios de pesquisa (Laboratório de Pesquisa em Química dos Produtos Naturais (LPQPN), Central Analítica do Laboratório de Pesquisas em Química de Produtos Naturais e Novas Metodologias Sintéticas em Química Orgânica - CALPQPN, Laboratório de Análise de Resíduos de Biocidas - LARB, Laboratório de Modelagem Molecular - LMM, Laboratório Computacional de Materiais - LCM, Laboratório  de Pesquisa em Bioquímica - LBQ, Laboratório de Pesquisa de Química Inorgânica (Materiais Inorgânicos), Laboratório GENMAT (Grupo de Eletroquímica e Novos Materiais), LACANM (Laboratório de Análise e Caracterização de Novos Materias), CEANC (Central Analítica de Combustíveis), Laboratório de Pesquisa em Ensino de Química - LabPEQ)  abrangendo as áreas de Química Analítica, Físico-Química, Química Orgânica, Química Inorgânica, Bioquímica e Ensino de Química. 

O Departamento de Química é dirigido pelo Chefe de Departamento que é designado através de eleição a cada 02 (dois) anos. Além da chefia, o departamento tem como órgão máximo de deliberação o Colegiado do Departamento, sendo composto por todos seus docentes, além de representantes dos servidores técnico administrativos e do corpo discente.