Tópicos Modernos em Zoologia II – Taxonomia, Sistemática e Genética 

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4 

Ementa:

Apresentar e comparar as abordagens tradicional (morfológica) e integrada (morfológica e genética) na delimitação de espécies e de táxons supra-específicos. Discutir vantagens e limitações da sistemática clássica e da sistemática molecular. Elencar as principais provisões e recomendações do Código Internacional de Nomenclatura Zoológica e tendências recentes da prática nomenclatural em diferentes níveis taxonômicos.

Bibliografia: 

Lemey, P.; Salemi, M.; Vandamme, A-M. (Eds.). 2009. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing. Cambridge University Press, Cambridge.

Hedges, S.B.; Kumar, S. (Eds.). 2009. The Timetree of Life. Oxford University Press, New York.

Mayr, E.;  P.D. Ashlock. 1991. Principles of systematic zoology. McGraw Hill INC.

Nomenclature c/o The Natural History Museum. London. 305 pp.

Papavero, N. 1994. Fundamentos práticos de taxonomia zoológica: Coleções, bibliografia, nomenclatura. 2. ed. São Paulo: Editora da UNESP & FAPESP. 185p.

Delineamento de Projetos em Zoologia 

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 30h

Créditos: 2 

Ementa:

Organização e apresentação do Projeto de Dissertação para avaliação e discussão preliminar com o professor responsável pela disciplina, com os colegas e com outros professores do quadro regular do PPGZ e convidados. Visa avaliar a base teórica, as hipóteses de trabalho e o delineamento do Projeto de Dissertação, sugerindo estratégias, avaliando eficiência e corrigindo problemas que possam ameaçar a implementação da dissertação nos prazos regulamentares. 

Bibliografia:

Estágio em Docência

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 30h

Créditos: 2

Ementa:

Auxílio ao docente responsável pelo planejamento, ensino de conteúdos, auxílio na execução de exercícios propostos e aulas práticas e avaliação de aprendizagem de disciplina coerente com a área do programa, de forma a desenvolver no aluno de pós-graduação as habilidades necessárias para a fundamentação do trabalho pedagógico.

Bibliografia:

Masetto, M. 1998. Docência na Universidade, 8 ed. Papirus, Campinas.

Cunha, M.I. 2005. Formatos avaliativos e concepção de docência. Autores Associados, Campinas.

Marques, M.O. 2006. A aprendizagem na medição social do aprendido e da docência, 3 ed. Inep, Brasília.

Anatomia e Morfologia Comparada de Invertebrados

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4 

Ementa:

Relações filogenéticas e diversidade dos filos animais. Anatomia e morfologia comparada de diferentes sistemas de invertebrados, com ênfase em Panarthropoda. Bibliografia:

Bibliografia:

Grassé, P-P (ed.). 1950-1979. Traité de zoologie, anatomie, systématique, biologie. ed. Masson, Paris. 38 vols.

Brusca, R.C.; Brusca, G.J. 2007. Invertebrados. Rio de Janeiro, RJ. Editora Guanabara Koogan.

Ruppert, E.E.; Barnes, R.D. 2007. Zoologia dos invertebrados: uma abordagem funcional-evolutiva. 7ª. edição. São Paulo, SP. Editora

Roca.

Cracraft, J.; Donoghue, M.J. 2004. Assembling the Tree of Life.Oxford University Press, New York.

Anatomia e Morfologia Comparada de Vertebrados

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4 

Ementa:

Entendimento e discussão das relações filogenéticas e da diversidade dos cordados. Análise comparativa com enfoque evolutivo dos seguintes sistemas em cordados: Tegumentar, Esquelético, Muscular, Sensorial, Nervoso, Endócrino, Digestivo, Respiratório, Circulatório, Excretor e Reprodutor. 

Bibliografia:

Nielsen, C. 2001. Animal evolution: interrelationships of the living phyla. Oxford University Press, New York.

Cracraft. J. & M. Denoghue. 2004. Assembling the Tree of Life. Oxford University Press. Oxford. USA.

Hildebrand, M. 2006. Análise da Estrutura dos Vertebrados. 2 a Ed., Atheneu Editora São Paulo Ltda. 638 p. 

Kardong, K.V. 2011. Vertebrados: Anatomia Comparada, Função e Evolução. 5a ed. São Paulo. Roca.

Liem, K.F.; W.E. Bemis, W.F. Walker Jr.; L. Grande. 2001. Functional Anatomy of the 

Vertebrates: an evolutionary perspective. Brooks/Cole-Thomson Learning, Belmont, USA.

Pough, J. H; C.M. Janis; J.B. Heiser. 2008. A vida dos vertebrados. 4ª ed. São Paulo,

Atheneu.

Cromossomos: Diversidade e Populações

Nível: Mestrado Acadêmico 

Carga Horária: 60h 

Créditos: 4

Ementa da Disciplina:

Entendimento sobre as bases da citogenética clássica e molecular, enfocando a organização molecular da cromatina e seus níveis de compactação do cromossomo.  As alterações no sistema cromossômico: processos e fatores limitantes. Estudos da variabilidade cromossômica intra e inter-populacional. Análise de freqüências cromossômicas e cariotípicas nas populações e citotaxonomia. 

Bibliografia:

Gregory, T.M. 2005. The Evolution of the Genome. Elsevier Academic Press, USA. 

Guerra, M. 2004. FISH: Conceitos e Aplicações na Citogenética. Sociedade Brasileira de Genética, Ribeirão Preto. 

John, B. 1976. Population Cytogenetics. The Camelot Press Ltda., Southampton. 

Kasahara, S. 2009. Introdução à Pesquisa em Citogenética de Vertebrados. Sociedade Brasileira de Genética, Ribeirão Preto. 

Pisano, E.; Ozouf-Costaz, C.; Foresti, F.; Kapoor, B.G. 2007. Fish Cytogenetics. Science Publishers, Enfield. 

Mcgregor, H.C. 2008. Introduction to Animal Cytogenetics. Springer. 

Marcadores Moleculares e suas aplicações no estudo da Biodiversidade

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60 horas

Créditos: 4

Ementa:

O que são marcadores genéticos moleculares e seu uso nos estudos de genética animal. Discussão sobre marcadores morfológicos versus moleculares. As limitações da identificação dos genótipos. Aplicação dos marcadores moleculares na identificação do indivíduo, na variabilidade genética, nos estudos de parentesco, estrutura populacional geográfica e fluxo gênico. 

Bibliografia:

Avise , J.C. 2004. Molecular Markers, Natural History and Evolution. 2Ed. Sinauer Inc.

Hoezel, 1994. Molecular Genetic Analysis of Populations: a Practical Approach. 

2 ed. IRL Press, Oxford. University Press

Ferreira, M.E.; Gratapaglia, D. 1995. Introdução ao uso de marcadores moleculares RAPD e RFLP em análise genética. Embrapa. Brasília, DF. 220p. 

Hillis, D.M., Moritz, C.; Mable, B.K. 1996. Molecular Systematics. Sinauer Associates. Massachusetts. 655p.

Meyer, D. 1996. Árvores Evolutivas Humanas: Uma discussão sobre inferência filogenética. Série Monografias N. 3. Sociedade Brasileira de Genética. Ribeirão Preto. 1-162pp.

Meyer, D. 1997. Análise filogenética de sequências de DNA. In: Elementos básicos de sistemática filogenética. Amorim, D.S. (Ed.). Holos Editora e Sociedade Brasileira de Entomologia, Ribeirão Preto. 187-212pp.

Técnicas de Microscopia em Pesquisas Zoológicas 

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4

Ementa:

Estudo teórico-prático das técnicas de microscopia de uso corrente em zoologia. Preparação de amostras com e sem resinas plásticas e escolha de espessuras e distancias entre cortes com finalidades morfométricas. Técnicas de morfometria e formas de análises. Aplicações nas diferentes  áreas de  zoologia. Preparação de pranchas e esquemas a partir de imagens microscópicas. 

Bibliografia:

Tolosa, E.M.C; Rodrigues, C.J.; Behmer, O.A.; Neto, A.G.F. 2003. Manual de Técnicas para Histologia normal e patologica. Ed. Manole.

Carvalho, H.F.; Collares-Buzatto, C.B. 2005. Células: Uma Abordagem Multidisciplinar.

Barker, K 1998. Na Bancada. Ed. Artmed  

Biogeografia Histórica

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4

Ementa:

Biogeografia Histórica como a dimensão espacial da evolução; fatores históricos que afetam a distribuição dos seres vivos no espaço, padrões de distribuição geográfica dos seres vivos, processos explicativos desses padrões. Diferentes correntes de pensamento por trás de interpretações de distribuições geográficas, metodologias utilizadas para: 1. representação e reconhecimento das áreas de distribuição de táxons particulares; 2. representação e reconhecimento de áreas de endemismo, padrões de distribuição, e metodologias de regionalização biogeográfica; 3. escolha entre os candidatos a processos geradores dos padrões encontrados, para explicá-los; hipóteses formuladas a partir da suposição de determinados processos e suas conseqüências. Análises biogeográficas centradas nas áreas e centradas nos táxons de interesse, importância do conhecimento filogenético associado aos táxons e geológico associado às áreas, como hipóteses ao menos parcialmente e necessariamente complementares.

Bibliografia:

Lomolino, M.V.; B.R. Riddle, R.J. Whittaker; J.H. Brown.  2010.  Biogeography, 4th Edition.  Sinauer Associates. 

Cox, B; Moore, P.D. 2009. Biogeografia - Uma Abordagem Ecológica e Evolucionária. LTC (Grupo GEN) 

Zunino, M; Zullini, A. 2003. Biogeografia: La Dimension Espacial De la evolucion. Fondo De Cultura Economica.

Morrone, J.J. 2007. Evolutionary Biogeography: An Integrative Approach with Case Studies. Columbia University Press. 

Lomolino, M.V.; Sax, D.F.; Brown, J.H. (editors) 2004. Foundations of Biogeography. University of Chicago Press.

Bioestatística

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4

Ementa: 

Discussão sobre conceitos, concepção de ciências e métodos científicos. Formulação e teste de hipóteses. Delineamento amostral e experimental. Apresentação e análise de dados. Análise exploratória de dados experimentais. Probabilidade: Variáveis aleatórias e modelos de distribuição discretos e contínuos. Introdução à inferência estatística. Teste t. Análise de Variância. Regressão e Correlação. Análise de Frequência. Testes livres de distribuição. Noções de análise multivariada.

Bibliografia 

Manly, B. 2008. Métodos Estatísticos Multivariados. Ed Artmed.

Sokal, R.R.; Rohlf, F.J. 1995. Biometry. Ed. Freeman, San Francisco.

Trudy, A.W. 1998. Introductory Statistic for Biology Students. Ed. Chapman & Hall/CRC.

Zar, J.H. 1999. Biostatical Analysis. Ed. Prentice Hall.

Sistemática Filogenética

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 60h

Créditos: 4

Ementa:

Revisão do histórico e bases filosóficas da Sistemática. Métodos e conceitos da inferência filogenética. Histórico da Sistemática; Importância do conceito de monofiletismo; Escolas de pensamento sistemático; Conceitos de homologia, homoplasia, caráter, apomorfia, plesiomorfia; Tipos de caracteres (binários, multiestados, ordenados e não-ordenados); Bases filosóficas da cladística e parcimônia; Codificação de caracteres; Grupos-externos, enraizamento e polarização; Otimização de caracteres: Critérios de otimização; Codificação e montagem de matrizes. Análise de congruência; Algoritmos de busca (exatos e heurísticos); Visualização de árvores (Tree view); Consenso, técnicas de consenso: consenso estrito, semi-estrito, e de maioria; Comprimento da árvore, índices de consistência e retenção; Medidas de suporte: bootstrap, jacknife, suporte de Bremer; Análise de sensibilidade; Papel dos missing values; Dados paleontológicos. Dados morfológicos e dados moleculares. Dados de ontogenia; Pesagem de caracteres.

Bibliografia:

Amorim, D.S. 2002. Fundamentos de sistemática filogenética. Editora Holos, Ribeirão Preto.

de Pinna, M.C.C. 1991. Concepts and tests of homology in the cladistic paradigm. Cladistics, 7:367-394.

Farris, J.S. 1983. The logical basis of phylogenetic analysis. In: Platnick, N. I.; Flunk, V.A. (Eds.), Advances in cladistics, vol. 2, Columbia University Press, New York, p.7-36.

Goloboff, P.A. 1993. Estimating character weights during tree search. Cladistics, 9:83-91.

Hennig, W. 1966 [1979]. Phylogenetic systematics. University of Illinois Press, Urbana.

Hull, D.L. 1988. Science as a process: an evolutionary account of the social and conceptual development of science. University of Chicago Press, Chicago.

Nelson, G.; Platnick, N.I. 1981. Systematics and biogeography: cladistics and vicariance. Columbia University Press, New York.

Nixon, K.C.; Carpenter, J.M. 1993. On outgroups. Cladistics 9:413-426.

Wiley, E.O.; Lieberman, B.S. 2011. Phylogenetics: theory and practice of phylogenetic systematics, 2 ed. Wiley-Blackwell, Hoboken.

Zoologia de Campo 

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 90h

Créditos: 4

Ementa: 

Apresentar os principais métodos de levantamento e monitoramento de diversidade de vertebrados e invertebrados com vistas à aplicação técnica e/ou científica, abordando as finalidades dos levantamentos em campo, ética e capacitação profissional, métodos de coleta e catalogação dos principais grupos de zoológicos, legislação associada à coleta e captura de exemplares, importância de acervos zoológicos como fonte de informação em estudos de diversidade animal, incorporação de material científico em coleções zoológicas. Esta disciplina será realizada com 30 horas de aula teórica e 60 horas de aula prática.

Bibliografia:

Auricchio, P.; Salomão, M.G. (Ed.). Técnicas de coleta e preparação de vertebrados para fins científicos e didáticos. São Paulo: Terra Brasilis, 2002.

Canadian Cataloguing in Publication Data. 1998. Inventory methods for terrestrial arthropods. (Standards for components of British Columbia's biodiversity ; no. 40).

Gibb, T.; Oseto, C. Arthropod Collection and Identification: Laboratory and Field Techniques. London, Elsevier, 2006.

Heyer, W.R. et al. (Ed.) Measuring and monitoring biological diversity. Standard methods for Amphibians. Washington, DC: Smithsonian Institution Press, 1994.

Matter, S. von et al. (Org.). Ornitologia e Conservação: Ciência Aplicada, Técnicas de Pesquisa e Levantamento. Rio de Janeiro: Editora Technical Books, 2010.

Fitch, H.S. 1987. Collecting and life-history techniques. In: Siegel, R.A.; Collins, J.T.; Novak, S.S. (Ed.) Snakes. Ecology and evolutionary biology. New York: Mac-Millan Publishing Company, p.143-64.

Science: how to talk and write about it

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45 h

Créditos: 3

Ementa:

The craft of scientific presentations is a major tool for academic careers in biology.

This course will focus on processes on scientific decision-making during the period of undergraduate and graduate studies. It includes the planning, structuring, writing, and presenting orally the results of scientific research. The course content will comprise the  structuring and writing of undergraduate monographs, graduate dissertations, and PhD theses. The second major emphasis will cover the writing of scientific publications and presentions of science at meetings and congresses (seminar talks, posters, congress orals).

Bibliografia:

Alley, M.1996.The Craft of Scientific Writing.Third Edition. Springer. New York.

Anholt R.R.H. 2010. Dazzle ´em With Style: The Art of Oral Scientific Presentation. Second Edition. Academic Press, New York.

Curadoria de coleções zoológicas

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45 h

Créditos: 3

Ementa:

Coleções zoológicas (espécimes, esqueletos, amostras em via liquida, tecidos, vocalizações, etc), são as mais importantes fontes de dados para as disciplinas zoológicas. Assim, a curadoria permanente deste material é de valor fundamental para futuras pesquisas em anatomia, morfologia, fisiologia, biogeografia, biologia molecular, genética, ecologia e conservação. Este curso irá abranger todos os temas de estabelecimento e conservação de coleções zoológicas (determinação taxonomica; catálogo escrito e digital com informaçoes anatômicas, ecológicas, dados geográficos georeferenciados; técnicas de taxidermia e preservação de espécimes coletados). Além de métodos de descrição de novas espécies de acordo com as regras internacionais de taxonomia e sistemática, será abordado como fazer o estabelecimento de inventários de espécies regionais visando à conservação. As análises de coleta de dados baseadas em estudos biogeográficos serão demonstradas com base em software de modelagem biogeográfica.

Bibliografia:

Mayr, E. & Ashlock, P. 1991. Principles of Systematic Zoology. Second Sub-edition. Mcgraw-Hill. 

Biologia da Conservação

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45h

Créditos: 3

Ementa:

Enfatizar a importância da conservação da biodiversidade na crise atual do modelo de desenvolvimento. Mostrar diferentes formas de caracterizar a biodiversidade. Discutir as diferentes estratégias para a conservação.

Bibliografia:

Primack, R.B.; E. Rodrigues. 2001. Biologia da Conservação. Londrina. 328 p.

Rocha, et al. 2006. Biologia da Conservação: Essências. São Carlos. 582 p.

Claudino-Sales, V. (org). 2003. Ecossistemas Brasileiros: Manejo e Conservação. Expressão Gráfica, Fortaleza.

Cullen, L., Jr., Rudran, R. e Valladares-Padua, C. (orgs). 2003. Métodos de Estudos em Biologia da Conservação e Manejo da Vida Silvestre. Editora UFPR, Curitiba.

Hunter-Jr., M.L. 1996. Fundamentals of Conservation Biology. Blackwell. Tauton.

McNeely, Miller, Reid, Mittermeier e Werner. 1990. Conserving the World’s biological diversity. IUCN. Gland.

Primack, R.B. 1993. Essentials of Conservation Biology. Sinauer. Sunderland.

Soulé, M.E. 1986. Conservation Biology: the science of scarcity and diversity. Sinauer. Sunderland.

Tópicos Especiais em Zoologia I

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45h

Créditos: 3

Ementa:

A disciplina Tópicos em Zoologia terá uma ementa aberta, que poderá ser utilizada para o oferecimento de diferentes disciplinas específicas relacionadas às áreas de atuação dos docentes da casa ou de visitantes nacionais e internacionais, a critério do Curso e em vista da demanda por parte dos alunos.

Bibliografia:

A bibliografia será indicada de acordo com a disciplina.

Tópicos Especiais em Zoologia II

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45h

Créditos: 3

Ementa:

A disciplina Tópicos em Zoologia terá uma ementa aberta, que poderá ser utilizada para o oferecimento de diferentes disciplinas específicas relacionadas às áreas de atuação dos docentes da casa ou de visitantes nacionais e internacionais, a critério do Curso e em vista da demanda por parte dos alunos. 

Bibliografia:

A bibliografia será indicada de acordo com a disciplina.

Tópicos Especiais em Zoologia III

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45h

Créditos: 3

Ementa:

A disciplina Tópicos em Zoologia terá uma ementa aberta, que poderá ser utilizada para o oferecimento de diferentes disciplinas específicas relacionadas às áreas de atuação dos docentes da casa ou de visitantes nacionais e internacionais, a critério do Curso e em vista da demanda por parte dos alunos. 

Bibliografia:

A bibliografia será indicada de acordo com a disciplina.

Tópicos Especiais em Zoologia IV

Nível: Mestrado Acadêmico

Carga horária: 45h

Créditos: 3

Ementa:

A disciplina Tópicos em Zoologia terá uma ementa aberta, que poderá ser utilizada para o oferecimento de diferentes disciplinas específicas relacionadas às áreas de atuação dos docentes da casa ou de visitantes nacionais e internacionais, a critério do Curso e em vista da demanda por parte dos alunos. 

Bibliografia:

A bibliografia será indicada de acordo com a disciplina.